More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2550 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
670 aa  1395    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
878 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.08 
 
 
810 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
3560 aa  105  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
1827 aa  104  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.73 
 
 
397 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.42 
 
 
1022 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
718 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
3145 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 
988 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.07 
 
 
795 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
543 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
3035 aa  94.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
833 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.91 
 
 
725 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
927 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
1252 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
1252 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
1406 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 
1056 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
711 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.27 
 
 
462 aa  90.9  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.94 
 
 
875 aa  90.5  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
828 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
828 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 
626 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
750 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 
614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 
1014 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
4489 aa  88.6  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
739 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
909 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
833 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
818 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 
1056 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 
626 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
614 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
1276 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.34 
 
 
582 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.25 
 
 
340 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
392 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 
979 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
3172 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  34.15 
 
 
661 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
1094 aa  87.4  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
637 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 
784 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
685 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.14 
 
 
539 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.87 
 
 
706 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
448 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
762 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.22 
 
 
816 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.11 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.37 
 
 
626 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
750 aa  86.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
824 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
1737 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
836 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
708 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
583 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
714 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.87 
 
 
764 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
3301 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 
1694 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.89 
 
 
623 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.77 
 
 
732 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
374 aa  84  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.02 
 
 
681 aa  84  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.79 
 
 
417 aa  84  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.22 
 
 
561 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.22 
 
 
561 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.51 
 
 
887 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
750 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
542 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
847 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
289 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
329 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.27 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.36 
 
 
706 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.98 
 
 
573 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.13 
 
 
733 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.41 
 
 
603 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
292 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
1192 aa  82  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.74 
 
 
865 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
361 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>