162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0057 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  35.06 
 
 
1165 aa  641  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  35.27 
 
 
1165 aa  640  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  35.3 
 
 
1187 aa  749  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  37.55 
 
 
1008 aa  714  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  40.24 
 
 
1194 aa  772  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  34.24 
 
 
1177 aa  680  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  100 
 
 
1205 aa  2366  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  37.97 
 
 
1182 aa  799  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  34.24 
 
 
1177 aa  680  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  34.43 
 
 
1165 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  34.49 
 
 
1208 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  2.09226e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  35 
 
 
1194 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  34 
 
 
1206 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  33.63 
 
 
1206 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  33.5 
 
 
1174 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  34.25 
 
 
1153 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  33.33 
 
 
1174 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  34.16 
 
 
1153 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.25 
 
 
1172 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  28.44 
 
 
1176 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  29.01 
 
 
1171 aa  359  2e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  27.69 
 
 
1102 aa  344  6e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.03 
 
 
1181 aa  331  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  26.96 
 
 
1212 aa  311  7e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  27.16 
 
 
1199 aa  301  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  24.59 
 
 
1182 aa  284  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.95 
 
 
1157 aa  280  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.39 
 
 
1179 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  26.34 
 
 
1207 aa  278  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  26.17 
 
 
1218 aa  276  1e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.08 
 
 
1192 aa  276  2e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  26.25 
 
 
1209 aa  275  5e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  27.59 
 
 
1175 aa  272  3e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.51 
 
 
1220 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60588e-05 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  25.2 
 
 
1164 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  28.22 
 
 
1204 aa  265  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  26.24 
 
 
1208 aa  265  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.59 
 
 
1175 aa  261  5e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  28.18 
 
 
1205 aa  261  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  25.77 
 
 
1209 aa  259  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.32 
 
 
1168 aa  259  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  22.3 
 
 
1130 aa  256  2e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  26.34 
 
 
1209 aa  256  2e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  26.34 
 
 
1209 aa  255  4e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  25.99 
 
 
1181 aa  254  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.49 
 
 
1268 aa  249  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  25.6 
 
 
1175 aa  248  5e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  26.47 
 
 
1302 aa  247  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  26.39 
 
 
1302 aa  247  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  25.83 
 
 
1302 aa  246  2e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28 
 
 
1152 aa  246  2e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  26.39 
 
 
1302 aa  246  2e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  25.68 
 
 
1211 aa  245  4e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  26.7 
 
 
1289 aa  236  1e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.02 
 
 
1302 aa  236  2e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.62 
 
 
1289 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  26.62 
 
 
1289 aa  234  8e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  26.2 
 
 
1302 aa  234  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.3 
 
 
1289 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  24.24 
 
 
1329 aa  223  2e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  26.42 
 
 
1365 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.12 
 
 
1173 aa  222  4e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.63 
 
 
1369 aa  221  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  24.23 
 
 
1348 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  27.2 
 
 
1173 aa  219  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  26.71 
 
 
1148 aa  214  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.09 
 
 
1366 aa  207  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  25.14 
 
 
1365 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  25.35 
 
 
1317 aa  183  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  21.87 
 
 
1164 aa  179  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  21.87 
 
 
1164 aa  179  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  25.14 
 
 
1358 aa  176  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  25.24 
 
 
1358 aa  176  3e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  25.24 
 
 
1358 aa  175  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  23.54 
 
 
1129 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  24.43 
 
 
1332 aa  173  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  22.69 
 
 
1195 aa  170  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  24.55 
 
 
1164 aa  169  3e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  22.98 
 
 
1275 aa  168  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  22.98 
 
 
1275 aa  168  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  24.15 
 
 
1167 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  24.15 
 
 
1167 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  24.15 
 
 
1167 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  24.15 
 
 
1167 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  24.04 
 
 
1147 aa  157  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.19 
 
 
973 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  20.86 
 
 
973 aa  155  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  23.96 
 
 
1104 aa  155  6e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  22.77 
 
 
1150 aa  151  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  31.35 
 
 
1176 aa  145  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  21.27 
 
 
1230 aa  139  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  31.93 
 
 
1179 aa  138  6e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 
831 aa  124  1e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  27.65 
 
 
831 aa  121  8e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  27.6 
 
 
831 aa  120  1e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>