294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1321 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  100 
 
 		 366 aa  753    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  46.24 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  46.88 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  42.47 
 
 		 380 aa  289  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 377 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.81 
 
 		 483 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  28 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.62 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 372 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.88 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 		 478 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.14 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  26.04 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.79 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  24.27 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.82 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.41 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.19 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.39 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.43 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.43 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  22.22 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.81 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  24.18 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 682 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 682 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.54 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  24 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.93 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  23.25 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.23 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  22.51 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.71 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.16 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  22.91 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.35 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  23.04 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.87 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  29.53 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>