More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0087 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  100 
 
 		 440 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  81.29 
 
 		 437 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  79.42 
 
 		 436 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  79.42 
 
 		 436 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  79.42 
 
 		 436 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  69.34 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  48.74 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  46.97 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  45.13 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  42.48 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  36.29 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  32.39 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  31.77 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.65 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.58 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.47 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.82 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.44 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.96 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.22 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.76 
 
 		 389 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  23.06 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  24.7 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.24 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.67 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  20.62 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.87 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  30.96 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.57 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  22.16 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  22.16 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
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NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  21.25 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.1 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  22.16 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  25 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  25.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.34 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  23.77 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  29.96 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.49 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  23.8 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.92 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.46 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  29.75 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.18 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.15 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.11 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.44 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.83 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.84 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.07 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  26.87 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  23.74 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  21.96 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  21.96 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  21.96 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  21.96 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  21.96 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.1 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.16 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.72 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.99 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.61 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  26.76 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.82 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.48 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  29.57 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.85 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  23.6 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.41 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.27 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.16 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  28.46 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  29.6 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.63 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.53 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.9 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.73 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.55 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  20.64 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.55 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.55 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
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NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  31.61 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.62 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.18 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  29.94 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  29.43 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  28.33 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  31.58 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  20.55 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
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