211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0322 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  46.93 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  47.46 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  38.55 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  44.13 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  40.22 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  39.11 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  37.1 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  37.64 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  39.77 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  39.2 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  40.44 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  33.33 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  38.04 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.8 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  37.08 
 
 		 195 aa  87.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  32.98 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.96 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.98 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  34.85 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.39 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  34.22 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.23 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  34.73 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  42.31 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.58 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.87 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.46 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  37.68 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.28 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.3 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  28.35 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  26.01 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  31.43 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.37 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  35.56 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  37.67 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  26.59 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  30.22 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.3 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  36.99 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>