More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1981 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1981  hflK protein  100 
 
 
403 aa  811  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  56.33 
 
 
413 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  51.05 
 
 
395 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  50.4 
 
 
405 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  48.71 
 
 
395 aa  362  5e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  45.55 
 
 
399 aa  337  2e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  46.17 
 
 
393 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  50.15 
 
 
391 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  40.3 
 
 
459 aa  325  9e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.31 
 
 
406 aa  318  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  41.67 
 
 
418 aa  313  2e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  42.43 
 
 
378 aa  313  3e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  45.78 
 
 
386 aa  313  4e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  40.92 
 
 
420 aa  307  2e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  44.13 
 
 
433 aa  308  2e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.76 
 
 
503 aa  306  4e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  46.44 
 
 
435 aa  305  8e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  44.66 
 
 
379 aa  305  1e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  45.53 
 
 
400 aa  304  2e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  45.65 
 
 
399 aa  304  2e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  40.53 
 
 
498 aa  304  2e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  45.1 
 
 
381 aa  304  2e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  45.1 
 
 
381 aa  304  2e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  44.38 
 
 
386 aa  303  3e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  43.05 
 
 
447 aa  302  7e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  41.48 
 
 
381 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  44.27 
 
 
393 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  41.08 
 
 
381 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  1.31875e-06 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  43.67 
 
 
400 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  45.78 
 
 
389 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  40.18 
 
 
436 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  43.77 
 
 
379 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.2736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  43.77 
 
 
379 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.65537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  43.77 
 
 
379 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.88714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  43.38 
 
 
386 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  41.81 
 
 
389 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  44.39 
 
 
393 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  44.39 
 
 
405 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  44.12 
 
 
393 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  44.94 
 
 
380 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  41.79 
 
 
395 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  43.21 
 
 
380 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  40.45 
 
 
383 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  41.46 
 
 
414 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  6.33953e-12 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  41.67 
 
 
383 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  40.35 
 
 
382 aa  288  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  41.4 
 
 
457 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  43.38 
 
 
379 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.20742e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  38.56 
 
 
382 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  40.75 
 
 
447 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  41.97 
 
 
381 aa  286  3e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  44 
 
 
380 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  44 
 
 
380 aa  286  6e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  40.68 
 
 
377 aa  285  1e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  39.85 
 
 
407 aa  284  2e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39.52 
 
 
475 aa  283  3e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  42.2 
 
 
407 aa  283  5e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  40.05 
 
 
456 aa  282  8e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  43.02 
 
 
451 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  43.02 
 
 
451 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  40.62 
 
 
420 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  39.09 
 
 
477 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  40.86 
 
 
464 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  39.03 
 
 
452 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  41.46 
 
 
471 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  46.89 
 
 
351 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  41.25 
 
 
390 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  42.16 
 
 
395 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  40.27 
 
 
471 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  40.34 
 
 
474 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  39.39 
 
 
420 aa  273  4e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  40.72 
 
 
386 aa  272  7e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  41.41 
 
 
401 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  42.01 
 
 
383 aa  269  6e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  40.19 
 
 
419 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  40.45 
 
 
464 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  40.59 
 
 
419 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  38.81 
 
 
421 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  40.59 
 
 
419 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  42.55 
 
 
394 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  40.59 
 
 
419 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  40.76 
 
 
415 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  42.98 
 
 
393 aa  267  3e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.32 
 
 
385 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  41.24 
 
 
419 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  43.81 
 
 
361 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.58 
 
 
367 aa  266  6e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  41.6 
 
 
419 aa  266  6e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  42 
 
 
385 aa  266  6e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  40.88 
 
 
460 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  40.71 
 
 
401 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  2.32279e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  41.35 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  39.71 
 
 
465 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  41.74 
 
 
382 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>