More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5834 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
876 aa  843  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  79.57 
 
 
892 aa  1400  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
897 aa  825  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
876 aa  891  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
863 aa  696  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
876 aa  890  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
875 aa  857  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
880 aa  696  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
897 aa  833  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
877 aa  672  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  79.47 
 
 
891 aa  1392  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
875 aa  857  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
865 aa  814  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
874 aa  863  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
876 aa  663  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
874 aa  840  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
874 aa  870  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
874 aa  874  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
876 aa  738  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  79.75 
 
 
891 aa  1398  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
878 aa  642  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
882 aa  825  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
888 aa  840  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
874 aa  869  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
876 aa  890  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
874 aa  873  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  70.36 
 
 
901 aa  1283  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
884 aa  755  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
874 aa  875  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1437  alanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
874 aa  808  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.738644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
875 aa  765  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79189e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
884 aa  758  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
886 aa  1779  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
879 aa  644  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
874 aa  851  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
889 aa  673  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1429  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
842 aa  689  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
904 aa  783  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
880 aa  647  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  69.08 
 
 
885 aa  1217  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
874 aa  845  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
874 aa  860  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
872 aa  855  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  4.64441e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  70.03 
 
 
887 aa  1245  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
876 aa  638  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
903 aa  843  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
931 aa  721  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
897 aa  831  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0508  alanyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 
887 aa  1009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  69.2 
 
 
885 aa  1224  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
876 aa  638  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
875 aa  857  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0986  alanyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
845 aa  694  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  63.49 
 
 
887 aa  1086  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  2.32232e-10 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
876 aa  753  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
875 aa  848  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 
892 aa  900  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
874 aa  884  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0051  alanyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
852 aa  695  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
876 aa  892  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
876 aa  891  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
865 aa  833  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
905 aa  717  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  6.4855e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
865 aa  818  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  73.39 
 
 
884 aa  1199  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 
913 aa  1115  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
867 aa  662  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0686  alanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
852 aa  682  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00144447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
863 aa  685  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
869 aa  849  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
888 aa  657  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
875 aa  810  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
875 aa  869  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
875 aa  881  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  52.98 
 
 
876 aa  890  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
875 aa  848  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
893 aa  840  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  69.04 
 
 
884 aa  1243  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
877 aa  650  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
874 aa  799  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
874 aa  836  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
845 aa  719  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
874 aa  818  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 
887 aa  1225  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
865 aa  853  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
889 aa  638  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
879 aa  829  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
879 aa  729  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
882 aa  670  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
870 aa  670  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1667  alanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
846 aa  713  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0503075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
953 aa  643  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
860 aa  839  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
890 aa  795  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
872 aa  833  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
875 aa  867  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
874 aa  660  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
880 aa  796  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
878 aa  697  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
879 aa  666  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>