More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2822 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1051    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  65.39 
 
 		 524 aa  683    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  68.41 
 
 		 460 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  39.03 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  39.65 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  40.96 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  39.28 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  40.4 
 
 		 531 aa  363  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 526 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 526 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  37.97 
 
 		 526 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 532 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  35.58 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  38.61 
 
 		 523 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 528 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  35 
 
 		 528 aa  316  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  35.43 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.5 
 
 		 528 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  34.58 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 531 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  36.38 
 
 		 595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 520 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  33.61 
 
 		 520 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  34.12 
 
 		 519 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  33.93 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.81 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  31.55 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 526 aa  253  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 514 aa  242  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 535 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.68 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.89 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 516 aa  200  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.31 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.9 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  28.88 
 
 		 528 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 		 522 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 532 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 538 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.08 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 515 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.33 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 505 aa  183  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.47 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.05 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 523 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.28 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.7 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 497 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>