90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1128 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  75.27 
 
 
546 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
547 aa  1075    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  52.33 
 
 
583 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  48.59 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  48.52 
 
 
477 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
512 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.4 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
505 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.5 
 
 
517 aa  77  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
453 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.14 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
483 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
433 aa  67  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 
471 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
461 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 
489 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 
486 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
458 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  30.37 
 
 
433 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 
504 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
476 aa  57  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.11 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
426 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 
539 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
460 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  31.61 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
459 aa  54.7  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 
451 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
488 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  25.26 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  25.1 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 
444 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
509 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 
490 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
478 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.86 
 
 
483 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 
477 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.91 
 
 
476 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.6 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  28.34 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  27.75 
 
 
458 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
429 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
478 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 
440 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  20.06 
 
 
478 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
492 aa  47.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
455 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
490 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 
519 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 
449 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2453  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 
596 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 
474 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
495 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  26.14 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 
482 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  26.8 
 
 
466 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
471 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  21.74 
 
 
544 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>