More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2453 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2453  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 596 aa  1128    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  38.42 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0314  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 		 562 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 527 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  41.56 
 
 		 511 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  36.5 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  37.84 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  37.84 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  34.64 
 
 		 511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.87 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 		 498 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  35.36 
 
 		 529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  33.54 
 
 		 523 aa  236  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  33.54 
 
 		 526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  32.05 
 
 		 523 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  32.21 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.03 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.39 
 
 		 512 aa  232  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  33.82 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  34.44 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  34.44 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  33.61 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  34.44 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  34.44 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.96 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  36.4 
 
 		 522 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 515 aa  223  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  34.65 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  36.22 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  35.67 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  35.33 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  34.58 
 
 		 515 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.09 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.85 
 
 		 513 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  31.62 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 519 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.58 
 
 		 513 aa  213  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.05 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.47 
 
 		 512 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  34.17 
 
 		 521 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.87 
 
 		 508 aa  209  9e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  36.63 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  34.17 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.21 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 512 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  36.63 
 
 		 535 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  34.3 
 
 		 512 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 522 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  35.33 
 
 		 525 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.97 
 
 		 523 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  30.09 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  37.27 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  28.98 
 
 		 519 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  30.96 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  28.55 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  29.39 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  36.52 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.11 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.45 
 
 		 518 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  30.27 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  34.45 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  33.09 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  35.33 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>