More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2654 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.5 
 
 
256 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
247 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
240 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
258 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
253 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
247 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.18 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
252 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.1 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
253 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  35.32 
 
 
244 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
260 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
253 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
251 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
256 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
242 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
250 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  30.92 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
256 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  44.3 
 
 
179 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
249 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  36.06 
 
 
256 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
246 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
252 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
252 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.78 
 
 
250 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0143  Short-chain dehydrogenase (D-alanine transfer protein)  36.17 
 
 
261 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
290 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46707  predicted protein  45.08 
 
 
260 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
293 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
267 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 
268 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
246 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 
263 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
266 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
243 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
237 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  29.52 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
360 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.3 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
262 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 
243 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  36.41 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
261 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  29.34 
 
 
281 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
265 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0999  putative short-chain dehydrogenase  33.7 
 
 
241 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
265 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
281 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>