More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3021 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  91.42 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  88.06 
 
 		 268 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  87.69 
 
 		 268 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  58.94 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  60.54 
 
 		 262 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.85 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  51.94 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  43.77 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  40.61 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  49.76 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  38.55 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.94 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.2 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.2 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.82 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  28.44 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.82 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  26.82 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.82 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.82 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.82 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.82 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  27.16 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  32.4 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.91 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 332 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  31.9 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 290 aa  98.6  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  31.9 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>