More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2005 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
258 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  48.21 
 
 
253 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
257 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
260 aa  221  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
252 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
254 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
250 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
253 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
278 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
264 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  47.09 
 
 
252 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
252 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
251 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
256 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
256 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
252 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
252 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
252 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  38.16 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  33.74 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 
251 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
247 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  31.33 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
253 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
241 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
256 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
253 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
248 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
250 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0143  Short-chain dehydrogenase (D-alanine transfer protein)  31.82 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  38.65 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
247 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46707  predicted protein  39.56 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
261 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
261 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.95 
 
 
257 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
264 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.17 
 
 
257 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
252 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
258 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  32.67 
 
 
264 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
269 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
267 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
262 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
262 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
261 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  29.61 
 
 
261 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
268 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05556  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.11 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
321 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  28.14 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.83 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62919  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.41 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
256 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  29.02 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  27.24 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  28.43 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.79 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>