More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2977 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.79 
 
 
268 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
273 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5132  hypothetical protein  71.6 
 
 
106 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.63 
 
 
236 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
268 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
281 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.12 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
274 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 
268 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  34.98 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  31.06 
 
 
263 aa  112  9e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.85 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.65 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  34.65 
 
 
267 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
256 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
273 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
267 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
248 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
266 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
344 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 
441 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
249 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 
268 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
323 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
299 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
245 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
244 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  34.02 
 
 
847 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
347 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
246 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
280 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
264 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.111652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
256 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
257 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
257 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  31.65 
 
 
275 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 
268 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
258 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
256 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
257 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
279 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
284 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
284 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
238 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
281 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
287 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34 
 
 
261 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
268 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
263 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
266 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.98 
 
 
261 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
314 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
286 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
284 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.82 
 
 
258 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
258 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
292 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
280 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
255 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.32 
 
 
255 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
259 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
255 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
246 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
338 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
243 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  32.37 
 
 
270 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
266 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
294 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
264 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
276 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
274 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
327 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>