More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0951 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  46.64 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  47.27 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  42.02 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.32 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.25 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.25 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.25 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 290 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.25 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.88 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.82 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.76 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.22 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  33.18 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  29.62 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 360 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  34.17 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.23 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.14 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.97 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.7 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  27.88 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.53 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>