More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1284 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 279 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 265 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  37.94 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.94 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  40.76 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 290 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  36.55 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  42.33 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  34.22 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2584  ketoreductase  39.18 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  40.11 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.19 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_5780  predicted protein  37.57 
 
 		 194 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.155733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.8 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.41 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.41 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.41 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 344 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.41 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.41 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.8 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.17 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.41 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>