More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0547 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 268 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  33.73 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  32.79 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.02 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.09 
 
 		 304 aa  98.6  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.5 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.17 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 354 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.99 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 280 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 340 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 340 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.47 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.25 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.08 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.87 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 340 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  34.43 
 
 		 847 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.68 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.85 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.47 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.58 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.45 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.85 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.67 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.53 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  36.87 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.17 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.08 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.66 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.67 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.67 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.67 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.17 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.84 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.31 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  29.25 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.16 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>