More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02329 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  100 
 
 
238 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  49.52 
 
 
268 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  50 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  49.05 
 
 
268 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  49.76 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  46.73 
 
 
263 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 
261 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
264 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
262 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
279 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  39.05 
 
 
264 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  40 
 
 
265 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  40.49 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
264 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
268 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
268 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111601  normal  0.208822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
286 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2183  putative short-chain dehydrogenase  28.03 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.766621  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
276 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
265 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142527  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1949  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.650904  normal  0.189896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0313  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.02 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.97 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.3 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.638785  decreased coverage  0.00000422955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>