More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0137 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  50.94 
 
 
264 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  47.27 
 
 
268 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
268 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
268 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
268 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  43.77 
 
 
268 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
268 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
264 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
260 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  36.29 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  40 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
250 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
272 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
257 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
269 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
272 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
272 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
259 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 
259 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
263 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
258 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.65 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.65 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.03 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.65 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.92 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.65 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.65 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.03 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.27 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  37.44 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
264 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
258 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  32 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.68 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  30.31 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.33 
 
 
244 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
241 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1528  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  33.87 
 
 
245 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  33.87 
 
 
245 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  29.84 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.22 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  31.98 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  30.28 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1057  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  32.8 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1200  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  32.26 
 
 
245 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354003  hitchhiker  0.00226725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
230 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.5 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5270  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 
248 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
266 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
264 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2042  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
248 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000691929  decreased coverage  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2624  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000523839  unclonable  0.000000000127004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.55 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.17 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000227771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.82 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>