More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2432 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  46.2 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  34.66 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  32.52 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  43.79 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.91 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.22 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.91 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.96 
 
 		 847 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 342 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.52 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.52 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.52 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.52 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.52 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  32.54 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 339 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 317 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  32.72 
 
 		 847 aa  92  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.36 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  31.66 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  27.44 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  28.06 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.44 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 309 aa  88.6  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  34.03 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  34.03 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.97 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.97 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>