More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2032 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.03 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  45.74 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.14 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  42.37 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  40.44 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  29.12 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.12 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.12 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.12 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.12 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.12 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  38.02 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.12 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.12 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.64 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 256 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  29.48 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.18 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.74 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.54 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 231 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 300 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  34.21 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.41 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  30.73 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02908  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.66 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0655  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.58 
 
 		 233 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>