More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003615 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  100 
 
 
264 aa  543  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  50.94 
 
 
265 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 
264 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
268 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
264 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
279 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  44.23 
 
 
263 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
268 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 
268 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  41 
 
 
268 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
261 aa  185  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
262 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 
265 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  41.31 
 
 
281 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
260 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 
238 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
251 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
257 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
268 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
269 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.1 
 
 
264 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.26 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
272 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
258 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0167  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
241 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000024572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
259 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
274 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.86 
 
 
264 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.86 
 
 
264 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37 
 
 
245 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  26.72 
 
 
264 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
264 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.72 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.72 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
241 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.34 
 
 
265 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
264 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
269 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1089  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
290 aa  99  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.47 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.45 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.38 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.74 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.95482  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.34 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.32 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
264 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.08 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
266 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2624  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000523839  unclonable  0.000000000127004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.38 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.765065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.03 
 
 
245 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.46 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000690955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  27.9 
 
 
333 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.93 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.04 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
257 aa  92  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
260 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.91 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000339194  hitchhiker  0.00000190522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>