More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03395 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
279 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
268 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
263 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
268 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
268 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
268 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 
261 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
268 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
264 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  41.31 
 
 
264 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
262 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
265 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
264 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 
238 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
269 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
241 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
242 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
264 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
274 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
293 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
281 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
266 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
266 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
272 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
250 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.45 
 
 
236 aa  99  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.31 
 
 
241 aa  99  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  98.6  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  30 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
249 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0324454  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.22 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
264 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1897  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 
245 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114593 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.78 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  35.48 
 
 
245 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.7 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
249 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  30.18 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 
277 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
256 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
257 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  30.77 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1233  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.08 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00223298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.85 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
251 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
240 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
238 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  28.46 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.84 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.69 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
239 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.85 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.46 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.46 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23050  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.51 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.46 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  26.46 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0167  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 
241 aa  89.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000024572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>