More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1811 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
250 aa  244  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
241 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
247 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.05 
 
 
253 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
256 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
257 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
260 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
253 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  43.33 
 
 
179 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  32.08 
 
 
244 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  30.12 
 
 
263 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.15 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
253 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
259 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
256 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  35.81 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
253 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
252 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
252 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
251 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
252 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
248 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
251 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
269 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.94 
 
 
230 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
264 aa  99  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
265 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
319 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46707  predicted protein  43.51 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  29.6 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
268 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
223 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
251 aa  91.7  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
260 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  29.96 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  30.98 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.96 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
264 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
258 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
257 aa  89  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
262 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
262 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  32.21 
 
 
313 aa  88.6  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 
274 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.36 
 
 
248 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
262 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
262 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948025  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.36 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.36 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
271 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.36 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.36 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
264 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>