More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2666 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  510  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  45.17 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  44.79 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  44.79 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  37.11 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0137  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.122699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02329  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0656015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03395  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  37.07 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0883898  normal  0.373217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0292  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 290 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.11 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  33.04 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 256 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  35.65 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.12 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  30.04 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.04 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  30 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  30 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.04 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.42 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.25 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.25 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.64 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.04 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  39.47 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.77 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>