More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2466 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
283 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
266 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
266 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
281 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
281 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  43.01 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
266 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
266 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
265 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
266 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
266 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
266 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
265 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
271 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
266 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 
262 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
266 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
270 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  43.45 
 
 
265 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
268 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
264 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
266 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
270 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
259 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
257 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
264 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
269 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.590645  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
261 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
269 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
258 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
269 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
260 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  42.29 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
271 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
261 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
261 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
264 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
267 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.14087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
259 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.27 
 
 
296 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
260 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
271 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.78 
 
 
264 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
269 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
262 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
252 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
255 aa  148  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.35 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
260 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  38.15 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
259 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
258 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
270 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
262 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
267 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
267 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
267 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
267 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
263 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
262 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.04 
 
 
262 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
255 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
259 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
258 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
262 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
264 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
250 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
264 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.3 
 
 
264 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>