More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2093 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.32 
 
 		 544 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 		 264 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.94 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 330 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 332 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.95 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.95482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.36 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.49 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 268 aa  98.2  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.9 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 293 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.36 
 
 		 264 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.36 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  32.97 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 328 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 248 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 		 279 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.9964  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 264 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 278 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.36 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.54 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.36 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 286 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.47 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.73 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  30 
 
 		 279 aa  92.8  4e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 282 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 337 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 282 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 333 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 272 aa  92  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  32.42 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 		 281 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 292 aa  92  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.24 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>