More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1309 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.05 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.75 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.11 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.59 
 
 		 266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.39 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 247 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  42.34 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.51 
 
 		 277 aa  158  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 314 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  41.12 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 242 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.1 
 
 		 274 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.6 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  37.23 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  33.33 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 291 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.98 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.09 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 281 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>