More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.37 
 
 
247 aa  330  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.96 
 
 
245 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.43 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.68 
 
 
289 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  63.32 
 
 
259 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.68 
 
 
247 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.68 
 
 
247 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
247 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.49 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.38 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
247 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.05 
 
 
249 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.44 
 
 
248 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
249 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
242 aa  251  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
249 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0662  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
249 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  0.469625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
249 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
249 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
249 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
249 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.912648  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.88 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.93 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
268 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
272 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
268 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
271 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
267 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
271 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
265 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.68 
 
 
277 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
273 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.71 
 
 
274 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
268 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
275 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  40.7 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
306 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
281 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 
279 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
277 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.9 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
314 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
286 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 
278 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 
271 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
286 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  40.57 
 
 
275 aa  131  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
344 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.94 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  44.25 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
275 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
276 aa  128  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 
287 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.47 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.49 
 
 
298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  42.78 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  41.67 
 
 
847 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.94 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
267 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
272 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.11 
 
 
847 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
298 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  42.61 
 
 
275 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
273 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.81 
 
 
276 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
280 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  44.89 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
286 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
273 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
284 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
273 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
291 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>