More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2109 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.87 
 
 
247 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  73.71 
 
 
259 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
249 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.82 
 
 
249 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.78 
 
 
249 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.2 
 
 
249 aa  290  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.45 
 
 
247 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  58.44 
 
 
244 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.91 
 
 
242 aa  278  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0662  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.1 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  0.469625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.83 
 
 
249 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.83 
 
 
249 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.83 
 
 
249 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 
247 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.6 
 
 
249 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.02 
 
 
249 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.912648  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 
256 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.02 
 
 
245 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
247 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
289 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
247 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
245 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
276 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
268 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
267 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
272 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
268 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
268 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
271 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
266 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
272 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
265 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 
284 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
282 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
279 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
268 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
284 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
281 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.19 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
307 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.33 
 
 
287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
279 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 
268 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 
847 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
291 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
292 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
280 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
286 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
271 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
277 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.1 
 
 
274 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
268 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  37.86 
 
 
847 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 
280 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  38.76 
 
 
272 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
282 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
282 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.21 
 
 
304 aa  121  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  32.14 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.94 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
276 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
275 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 
291 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
280 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
276 aa  118  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>