More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1830 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.54 
 
 
249 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.27 
 
 
249 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0662  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.85 
 
 
249 aa  349  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  0.469625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.03 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  70.13 
 
 
259 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.19 
 
 
249 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.19 
 
 
249 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.15 
 
 
249 aa  327  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.912648  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.88 
 
 
249 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.11 
 
 
249 aa  322  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.22 
 
 
242 aa  318  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.52 
 
 
249 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.98 
 
 
247 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  59.92 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.45 
 
 
248 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
289 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
247 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
247 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.55 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.18 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.37 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
276 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
266 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
268 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
271 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
272 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.42 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
265 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
271 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
272 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
268 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
268 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
267 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
338 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
282 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
317 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  40.7 
 
 
304 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
268 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.31 
 
 
274 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  41.57 
 
 
847 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
275 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
280 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  41.01 
 
 
847 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
282 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  38.03 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  37.97 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
279 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
283 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
307 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  44.63 
 
 
274 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
307 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  42.37 
 
 
276 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
280 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
296 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.35 
 
 
298 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
314 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
276 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
291 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
275 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
279 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
272 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
271 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
268 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 
276 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
291 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
274 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  35.48 
 
 
271 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
279 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
268 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
268 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
272 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 
291 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
291 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>