More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0869 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  500  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  70.37 
 
 
244 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.06 
 
 
289 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.06 
 
 
247 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.06 
 
 
247 aa  321  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.62 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.38 
 
 
245 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  66.08 
 
 
259 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
247 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.37 
 
 
245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 
249 aa  274  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 
248 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.44 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.61 
 
 
242 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.37 
 
 
249 aa  251  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 
249 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 
249 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0662  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.17 
 
 
249 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  0.469625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
276 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.83 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.83 
 
 
249 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.912648  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
271 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
272 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
266 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
272 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
271 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
282 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
268 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
265 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
273 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
268 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
268 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.46 
 
 
298 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.17 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.12 
 
 
277 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  40.12 
 
 
304 aa  131  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
268 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  39.61 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.77 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
273 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
277 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
278 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
292 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.91 
 
 
283 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
285 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
276 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
338 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 
276 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
317 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
282 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  36.78 
 
 
272 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
273 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
280 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 
280 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
283 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  43.18 
 
 
276 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
277 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
271 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
280 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
268 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
271 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  40 
 
 
268 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 
280 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
276 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.05 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
291 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
268 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.38 
 
 
270 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>