More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0982 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.79 
 
 
268 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  39.18 
 
 
236 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
287 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  34.82 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.07 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5132  hypothetical protein  66.27 
 
 
106 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
273 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
279 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
246 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
238 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
250 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.19 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
256 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
281 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  34 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
295 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
272 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
258 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 
274 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
342 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
259 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
276 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 
254 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
250 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
243 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
267 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3352  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
273 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
255 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 
273 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
339 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
272 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
275 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
245 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
252 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
314 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
266 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
283 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
247 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
284 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
274 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
258 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
230 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
246 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
261 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
247 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
244 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
272 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
264 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
272 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4200  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.13 
 
 
249 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
246 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
225 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
225 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.51 
 
 
544 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
254 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
347 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
267 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
267 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
267 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
267 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
267 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>