More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6941 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  60.24 
 
 
253 aa  290  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
250 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
258 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.05 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.55 
 
 
258 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.07 
 
 
269 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
254 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.23 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.87 
 
 
250 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
253 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
269 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
259 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
255 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.4 
 
 
249 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
258 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.98 
 
 
282 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 
263 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.59 
 
 
296 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
251 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
259 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
276 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
277 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
258 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
270 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
262 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.92 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.97 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  39.92 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
266 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
259 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
266 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
261 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  41.33 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
264 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
267 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
260 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
265 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
263 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
257 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  40.47 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
265 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
264 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
258 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
266 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.33 
 
 
264 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
263 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
269 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
271 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
264 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
264 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
262 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.29 
 
 
259 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
264 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
286 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
266 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
291 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
266 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
255 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
265 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
271 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
262 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  40.08 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
259 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
262 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
262 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
276 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
262 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
266 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
262 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  35.06 
 
 
259 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
266 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
267 aa  148  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
265 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
264 aa  148  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  35.06 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19470  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.02 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
281 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
269 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>