More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0089 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
259 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
269 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
271 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
262 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
261 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  47.47 
 
 
275 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
275 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
263 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
291 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
260 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
260 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
264 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
271 aa  198  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
258 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
264 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
263 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
257 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
273 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  47.19 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
256 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.43 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
260 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
263 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
360 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  42.17 
 
 
264 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
267 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  34.68 
 
 
259 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
289 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
267 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
267 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
267 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
344 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
262 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.74 
 
 
260 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
266 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
269 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
267 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  34.27 
 
 
259 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
257 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
262 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.07 
 
 
257 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
262 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
265 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
298 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
272 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
258 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
263 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
262 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.98 
 
 
257 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  41.5 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.78 
 
 
283 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
276 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.72 
 
 
259 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.97 
 
 
265 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  40.93 
 
 
261 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.5 
 
 
265 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
321 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
257 aa  149  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
261 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  34.68 
 
 
258 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
266 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.32 
 
 
263 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
266 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
267 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.91 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
250 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
266 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
269 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
261 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  46.28 
 
 
265 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
270 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
262 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
260 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
271 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>