More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1795 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.05 
 
 
261 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
261 aa  354  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.32 
 
 
260 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.2 
 
 
264 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  45.53 
 
 
275 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
260 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
275 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
291 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
273 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
264 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
269 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
259 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
264 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
262 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
271 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.62 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
256 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
289 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
263 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
257 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
263 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
263 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
267 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
344 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
262 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.92 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  36.99 
 
 
258 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
259 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
263 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
257 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
257 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  44.27 
 
 
261 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  39.08 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.52 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
262 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
271 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
261 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
255 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
265 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
286 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
360 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  37.7 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
258 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
259 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
266 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
258 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
276 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
262 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.21 
 
 
266 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.49 
 
 
258 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
256 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.01 
 
 
257 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
255 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
262 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.72 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
343 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  32.23 
 
 
259 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
277 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
281 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
262 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.23 
 
 
259 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
292 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.57 
 
 
265 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
267 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.57 
 
 
265 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.22 
 
 
257 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
261 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
259 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
259 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
256 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
267 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>