More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1352 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
264 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
261 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
261 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  43.45 
 
 
275 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
264 aa  198  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
264 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
260 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
271 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
260 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
275 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
259 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 
263 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
258 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
262 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
262 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
257 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
273 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
266 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
269 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.51 
 
 
266 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.98 
 
 
267 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
262 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
272 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
256 aa  175  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
257 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
259 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
269 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
269 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
270 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
255 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
261 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
258 aa  161  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
255 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
262 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
264 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
262 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  37.3 
 
 
258 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
267 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
261 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
277 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
258 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  34.02 
 
 
259 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
298 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
270 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
259 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
257 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.1 
 
 
261 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
283 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
264 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
263 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
267 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
259 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
266 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
263 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
321 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.91 
 
 
258 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  33.61 
 
 
259 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
258 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
266 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
263 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
261 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
360 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.19 
 
 
258 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
271 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 
263 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
344 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
250 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.11 
 
 
260 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 
266 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
266 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
259 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
252 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.08 
 
 
259 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
266 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.33 
 
 
253 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
265 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
268 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>