More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5008 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
344 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 
265 aa  255  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  46.62 
 
 
264 aa  232  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  46.95 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
289 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
264 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
267 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
260 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
261 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
267 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
262 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
260 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
256 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  40.25 
 
 
259 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  39.83 
 
 
259 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
257 aa  172  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
263 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
261 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
257 aa  169  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
258 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
266 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
265 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
261 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
264 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
259 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.7 
 
 
258 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
259 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.85 
 
 
257 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.13 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
271 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
259 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 
266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
276 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
267 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
269 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.25 
 
 
257 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.82 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
265 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.77 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
263 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
262 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
262 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
272 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
263 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  33.72 
 
 
275 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
258 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  34.55 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  35.74 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
262 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
256 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
260 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
257 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  36.86 
 
 
249 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.8 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
256 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
273 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
266 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
271 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
259 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
269 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
273 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08398  conserved hypothetical protein  37 
 
 
364 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.86 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
291 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.89 
 
 
260 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
267 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
267 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>