More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3857 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
265 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
266 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
268 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
271 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.95 
 
 
231 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.95 
 
 
231 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.95 
 
 
231 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198957  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 
261 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
267 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  47.43 
 
 
249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
265 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
289 aa  181  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
256 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  36.88 
 
 
264 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
298 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
344 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
259 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  36.56 
 
 
261 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
257 aa  135  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
267 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.5 
 
 
257 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.47 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.83 
 
 
258 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
266 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
263 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
294 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
269 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
343 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
259 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
272 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  32.47 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
291 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
269 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  37.39 
 
 
267 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.94 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
256 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
265 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
268 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
255 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.03 
 
 
259 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
266 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08398  conserved hypothetical protein  33.58 
 
 
364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
257 aa  109  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
263 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
271 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
257 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
260 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
261 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
253 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
258 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
262 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
289 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
255 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
258 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
258 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
252 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
264 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
264 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
264 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
263 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.08 
 
 
258 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
267 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
267 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
292 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
262 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
262 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
267 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.6 
 
 
296 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>