More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4503 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  93.8 
 
 		 258 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1588  short chain dehydrogenase  74.03 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0912  short chain dehydrogenase  74.03 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1148  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1964  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1983  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00829881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0248  short chain dehydrogenase  74.03 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2387  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4060  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47060  short chain dehydrogenase  59.3 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  46.77 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2216  short chain dehydrogenase  48.22 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1584  short chain dehydrogenase  44.79 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6247  short chain dehydrogenase  44.79 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893931  normal  0.68092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4362  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0228985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1470  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.826438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1209  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  42.35 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.68 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  35.54 
 
 		 847 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 272 aa  121  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  34.15 
 
 		 847 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.51 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  36.36 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>