More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1227 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198957  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
267 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
263 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
268 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
271 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
267 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
261 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
261 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
265 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
231 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
231 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
231 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  35.22 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
344 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
263 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  33.77 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.55 
 
 
258 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.26 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
273 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
256 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.13 
 
 
257 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
289 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
263 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
260 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
360 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
298 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  30.8 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
250 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
257 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
267 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
266 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
261 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
260 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
267 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
264 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
267 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.78 
 
 
266 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  35 
 
 
266 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
262 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
259 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
257 aa  102  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 
321 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
263 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
263 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
280 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
262 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
291 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
264 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
260 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  33.33 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
592 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.46 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
259 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
258 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
268 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  29.57 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0425184  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  31.25 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
292 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>