More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5157 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
224 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0425184  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.28 
 
 
236 aa  305  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.19 
 
 
235 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
229 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
233 aa  175  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
248 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0693  sepiapterin reductase  31.82 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
243 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
241 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.05 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
241 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.68 
 
 
238 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  32.48 
 
 
239 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
223 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
243 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.86 
 
 
253 aa  106  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
223 aa  104  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
241 aa  104  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 
238 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.05 
 
 
227 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
244 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
243 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  29.57 
 
 
241 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
246 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
243 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
251 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0596  sepiapterin reductase  29.1 
 
 
243 aa  101  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
240 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
243 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 
242 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
267 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.62 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.63 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  32.5 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.15 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
280 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  30.71 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  29.44 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.35 
 
 
243 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
238 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
252 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
239 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.73 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
280 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
267 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.07 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
264 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
264 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 
275 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
339 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
250 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
261 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198957  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
243 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
250 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
297 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3169  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000352781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  26.41 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.22 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3420  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.09 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3407  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.09 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>