More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2871 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 
267 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.95 
 
 
263 aa  228  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.18 
 
 
265 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
261 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3335  hypothetical protein  46.5 
 
 
249 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.255614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
265 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
267 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
261 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198957  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
256 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
344 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  32.74 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  33.85 
 
 
261 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
257 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.55 
 
 
257 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
263 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.33 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
259 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
263 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
259 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 
262 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
257 aa  102  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
257 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
289 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
260 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
343 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
261 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
266 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.84 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
260 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
291 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08398  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 
364 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  27.8 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  37.82 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.71 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
253 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
256 aa  89  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
257 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
258 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
270 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.61 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
265 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
268 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  34.68 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>