More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2195 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  487  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.2 
 
 
250 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.6 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.71 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
259 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  59.52 
 
 
253 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.61 
 
 
269 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
263 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
269 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
258 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
269 aa  237  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
255 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
251 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
258 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
258 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
258 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
259 aa  208  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.68 
 
 
282 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50.99 
 
 
258 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.52 
 
 
296 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
258 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
276 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.33 
 
 
249 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
269 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
259 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19470  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.8 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
263 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
270 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
270 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
258 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
260 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
277 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
262 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
265 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
263 aa  161  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
263 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
281 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
281 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
267 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
264 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
257 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.2 
 
 
267 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
273 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  40.86 
 
 
266 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 
264 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
264 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
264 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
266 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
266 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  40.62 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
266 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.5 
 
 
265 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
265 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
271 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.5 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.61 
 
 
258 aa  151  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
264 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
266 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
259 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
267 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
262 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
262 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 
270 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
265 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
262 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
267 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
259 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.06 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
261 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  40.71 
 
 
265 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
264 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
266 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
258 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
269 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
263 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
271 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
255 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
260 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  39.38 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>