More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3113 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  517  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  63.81 
 
 
267 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
266 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.43 
 
 
258 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
268 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
263 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
267 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
262 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
261 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
259 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
260 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  43.32 
 
 
259 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38.68 
 
 
275 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
264 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  40.82 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
259 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
256 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
266 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
267 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.67 
 
 
268 aa  154  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
264 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
260 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
268 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522448  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
266 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
259 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
275 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
292 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.51 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
281 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
259 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
281 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
259 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.08 
 
 
258 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
258 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
257 aa  152  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
266 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
259 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
264 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
271 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
264 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
266 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
263 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
262 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.37 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
256 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
266 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.95 
 
 
257 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
268 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.82 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
276 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
268 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
272 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
258 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
294 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
266 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
256 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
255 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
270 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
266 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
266 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
259 aa  142  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
262 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
264 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
262 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
269 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>