More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4541 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.111652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.59 
 
 
276 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0283  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.43 
 
 
265 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.43 
 
 
265 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.43 
 
 
265 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
268 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
249 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.330671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 
246 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
246 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
243 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
250 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
260 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
269 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
263 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
255 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
259 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  131  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  35.34 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
272 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
250 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
256 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
270 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 
245 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.08 
 
 
245 aa  125  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
252 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
249 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
255 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
240 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.7 
 
 
247 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.97 
 
 
245 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
291 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
249 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
254 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 
247 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.7 
 
 
248 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 
252 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 
246 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
254 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
254 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
254 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
264 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
240 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 
256 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
264 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
240 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
264 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0485  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.09 
 
 
247 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  31.7 
 
 
259 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.6 
 
 
249 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
254 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
252 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1509  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
247 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  39 
 
 
257 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
260 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
253 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
263 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  35.63 
 
 
257 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.1 
 
 
245 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 
246 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
259 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
253 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  34.34 
 
 
261 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.08 
 
 
247 aa  122  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
268 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  32.09 
 
 
256 aa  121  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>