More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3459 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.35 
 
 
250 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.93 
 
 
252 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  47.93 
 
 
252 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
250 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
251 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
252 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
256 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
252 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
252 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
252 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
251 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
256 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
253 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
252 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  41.3 
 
 
256 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
254 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
249 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  42.13 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
260 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
256 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
248 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
278 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
241 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0143  Short-chain dehydrogenase (D-alanine transfer protein)  36.57 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
247 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
241 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05556  conserved hypothetical protein  39.9 
 
 
266 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  36.22 
 
 
244 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  35.29 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  31.73 
 
 
263 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
247 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
250 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
246 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  40.26 
 
 
179 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46707  predicted protein  34.21 
 
 
260 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125621  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
592 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
274 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0999  putative short-chain dehydrogenase  34.2 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0933094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
238 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
272 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
257 aa  89  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  25.68 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
248 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.48 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  31 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
314 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  30.67 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
260 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  34.43 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.85 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  30.88 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>