More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4099 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
252 aa  309  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
253 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
252 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
252 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
252 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.61 
 
 
254 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  51.07 
 
 
252 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
252 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.78 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.24 
 
 
253 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.36 
 
 
251 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.9 
 
 
256 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
256 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
250 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 
250 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 
247 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  43.78 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
249 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.97 
 
 
257 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
264 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.89 
 
 
253 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.97 
 
 
264 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
258 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
257 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
247 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
256 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
241 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
278 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0143  Short-chain dehydrogenase (D-alanine transfer protein)  34.88 
 
 
261 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  28.02 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
241 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
252 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05556  conserved hypothetical protein  35.77 
 
 
266 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
272 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  33.04 
 
 
264 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
281 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
268 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
268 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  40.85 
 
 
179 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
261 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
272 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.87 
 
 
240 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
261 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
246 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
286 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
261 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  33 
 
 
313 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
250 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
268 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
317 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
293 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.98 
 
 
249 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  34.2 
 
 
244 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  33.14 
 
 
274 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
307 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
307 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
270 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
268 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  31.25 
 
 
254 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.98 
 
 
249 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
258 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  31.13 
 
 
304 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
263 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
275 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
279 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
265 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
314 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
248 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
307 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.45 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 
270 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
290 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
252 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.86 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.43 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  30.87 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>