More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5866 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117974  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.52 
 
 
256 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.52 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
252 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16840  short-chain dehydrogenase, teichoic and lipoteichoic acid D-alanine esterification  50.2 
 
 
256 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
251 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
251 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  50.43 
 
 
252 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
250 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
249 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
252 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
252 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
252 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
248 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
247 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
254 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
253 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
252 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
250 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  42.06 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
241 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
264 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488757  normal  0.0305569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
242 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
258 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
253 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00176111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243051  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
247 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0143  Short-chain dehydrogenase (D-alanine transfer protein)  37.21 
 
 
261 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277781  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.200672  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
278 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  32.24 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10469  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G01330)  35.02 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331607  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  34.36 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
240 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05556  conserved hypothetical protein  40.83 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
250 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3201  oxidoreductase protein  45.31 
 
 
179 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46707  predicted protein  37.42 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000475718  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  31.55 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.31 
 
 
243 aa  89  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
266 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.05 
 
 
246 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
243 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
665 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.5 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
671 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  28.45 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.04 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  33.87 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
274 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
268 aa  85.1  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  30.64 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.78 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0466  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  34.57 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.34924  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  28.33 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
360 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  31.18 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
284 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>