More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1632 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0383  large adhesin  47 
 
 
4238 aa  1096    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  49.5 
 
 
3737 aa  1046    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  100 
 
 
2914 aa  5831    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  62.06 
 
 
2851 aa  592  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  46.3 
 
 
3554 aa  343  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  28.69 
 
 
2906 aa  318  7e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  55.88 
 
 
4526 aa  310  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  57.94 
 
 
842 aa  296  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  37.46 
 
 
3078 aa  267  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  39.65 
 
 
5143 aa  265  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.75 
 
 
936 aa  259  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  33.19 
 
 
2092 aa  258  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  32.75 
 
 
2091 aa  254  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  53.86 
 
 
712 aa  250  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  50.22 
 
 
706 aa  241  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  46.44 
 
 
748 aa  240  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.71 
 
 
813 aa  240  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  49.08 
 
 
1580 aa  237  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  48.65 
 
 
1168 aa  236  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  46.96 
 
 
1147 aa  231  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  39.44 
 
 
3920 aa  230  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.21 
 
 
643 aa  221  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  51.56 
 
 
585 aa  207  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  30.01 
 
 
2078 aa  206  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  44.59 
 
 
835 aa  201  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  55.26 
 
 
442 aa  200  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  54.06 
 
 
512 aa  197  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  46.36 
 
 
1451 aa  194  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  28.53 
 
 
2073 aa  191  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  30.77 
 
 
2075 aa  189  7e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  33.7 
 
 
1813 aa  185  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  45.37 
 
 
1055 aa  185  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  41.67 
 
 
838 aa  185  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  44.85 
 
 
1170 aa  184  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  32.63 
 
 
2078 aa  182  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.2 
 
 
1408 aa  182  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  48.34 
 
 
459 aa  182  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  40.46 
 
 
815 aa  180  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  46.77 
 
 
462 aa  175  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  45.81 
 
 
1297 aa  174  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  60.21 
 
 
382 aa  170  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  43.54 
 
 
835 aa  169  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  40.7 
 
 
1219 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  45.4 
 
 
934 aa  165  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47.96 
 
 
835 aa  161  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  44.44 
 
 
645 aa  159  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  52.87 
 
 
606 aa  156  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  53.7 
 
 
582 aa  155  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  43.35 
 
 
1321 aa  152  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  39.5 
 
 
835 aa  151  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  41.68 
 
 
951 aa  147  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52.68 
 
 
403 aa  145  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  53.57 
 
 
400 aa  141  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.96 
 
 
492 aa  137  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  42.7 
 
 
1101 aa  137  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  44.92 
 
 
867 aa  135  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  54.69 
 
 
481 aa  133  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  53.09 
 
 
478 aa  133  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.74 
 
 
689 aa  132  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  50.49 
 
 
587 aa  132  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  50.58 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  49.59 
 
 
319 aa  128  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  47.19 
 
 
542 aa  126  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  36.79 
 
 
209 aa  124  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  39.05 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  39.56 
 
 
524 aa  117  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.91 
 
 
466 aa  116  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  47.14 
 
 
468 aa  116  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  38.63 
 
 
1873 aa  116  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  37.31 
 
 
1405 aa  116  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  33.11 
 
 
1014 aa  113  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  43.85 
 
 
444 aa  113  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  48.75 
 
 
473 aa  113  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  43.28 
 
 
582 aa  110  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  59.29 
 
 
437 aa  109  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  59.82 
 
 
439 aa  109  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  36.68 
 
 
639 aa  106  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  47.67 
 
 
474 aa  105  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  49.74 
 
 
300 aa  103  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.53 
 
 
827 aa  103  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  54.17 
 
 
344 aa  102  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  59.79 
 
 
451 aa  101  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  37.74 
 
 
426 aa  100  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  59.18 
 
 
437 aa  100  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  59.18 
 
 
437 aa  100  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  59.79 
 
 
438 aa  99.8  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  50 
 
 
348 aa  99  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  59.18 
 
 
434 aa  99  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.41 
 
 
523 aa  98.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  48.82 
 
 
307 aa  97.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  39.9 
 
 
1259 aa  96.7  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  30.81 
 
 
617 aa  94.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  50.53 
 
 
998 aa  93.2  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  54.21 
 
 
274 aa  92  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1597  hypothetical protein  29.69 
 
 
763 aa  91.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  55.74 
 
 
436 aa  91.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  42.78 
 
 
767 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  53.47 
 
 
1426 aa  91.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  49.25 
 
 
347 aa  89.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  49.25 
 
 
347 aa  89.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>